地球生物基因组计划已对3000个物种测序

中国科学报讯 6年前，2018年11月，科学家发起了一项雄心勃勃的计划——地球生物基因组计划，对大约167万种植物、动物、真菌和其他微生物的基因组进行测序。这项计划起初预计耗资47亿美元、耗时10年。相关负责人认为，拥有诸多完整的DNA序列将阐明生命进化过程，有助于保护环境、改善农业，甚至有利于人类健康。

目前来看，EBP筹集的资金还远远不够，并且进程比原计划落后了几年。正如组织者在近日一次会议上表示的那样，迄今EBP的全球合作伙伴对1060个真核家族的3000个物种进行了基因组测序，并有望在2026年达到1万个物种——这是EBP第一阶段的目标。

“在过去两年里，我们完成测序的基因组数量翻了一番。”EBP组织者之一、美国亚利桑那州立大学的基因组学家Harris Lewin说。

Lewin介绍，到目前为止，来自六大洲28个国家的科学家参与了EBP。对于EBP第二阶段的15万个物种，科学家希望产生非常详细的参考基因组，而不是最初设想的基因组草图。

目前，与EBP相关的测序工作每周大约能产生20个详细的真核生物基因组。为了赶上2026年第一阶段的最后期限，EBP的首要目标是在更多地方发展基因组学的测序能力。

然而，偏远贫困地区的动植物往往是最需要保护和研究的，它们的测序频率却较低。未参与EBP的美国克莱姆森大学的进化生态学家Antonio Baeza说:“EBP几乎没有‘全球南方’的参与。”

EBP设立了两个委员会，以解决伦理、法律、多样性和包容性方面的问题，并帮助在整个世界——而不仅仅是富裕国家，实现数据、技术的公平分配。

第一阶段工作预计花费2.65亿美元，不到最初预计的一半。EBP负责人希望到2032年实现167万个物种的测序目标。由于目前DNA测序速度更快、成本更低、准确性更高，实现这一目标所需的费用将比之前预计的少数亿美元。

EBP仍然需要数十亿美元，而要对所有真核生物进行测序，显然面临着更多挑战。但是研究人员认为，即使EBP只破译了预期基因组的1%，“也能为增进人们对生物多样性和生态系统的理解作出重大贡献”。

《中国科学报》

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